Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
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