Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPS29P62273 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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RPS29P62273 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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RPS29P62273 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPS29P62273 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
RPS29P62273 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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