Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms