Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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