Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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HOXA3O43365 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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