Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX15Q9NRS6 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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