Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TM6SF1Q9BZW5 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TM6SF1Q9BZW5 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms