Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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