Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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