Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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