Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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