Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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