Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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