Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PTCH1Q13635 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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PTCH1Q13635 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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