Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXE3Q13461 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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