Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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TCOF1Q13428 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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TCOF1Q13428 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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TCOF1Q13428 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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