Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NME3Q13232 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms