Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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