Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CAPN6Q9Y6Q1 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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