Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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