Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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