Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACHD1Q5VU97 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms