Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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