Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DNASE1L3Q13609 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms