Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXE3Q13461 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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