Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
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