Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms