Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
NME3Q13232 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NME3Q13232 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms