Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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