Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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