Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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RFXAPO00287 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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RFXAPO00287 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RFXAPO00287 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RFXAPO00287 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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