Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAMTA1Q9Y6Y1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms