Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD1Q9UP38 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms