Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms