Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PADI1Q9ULC6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms