Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP4Q9UKK3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms