Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXO5Q9H790 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms