Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CICQ96RK0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms