Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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