Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms