Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00116Q8NCU8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms