Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM5Q71RC9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms