Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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