Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA9Q16795 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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