Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LSAMPQ13449 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LSAMPQ13449 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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