Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPN13Q12923 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPN13Q12923 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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PTPN13Q12923 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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