Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms