Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbp4Q00724 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms