Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms