Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms